在收獲時好氧微生物（主要是酵母菌和霉菌）保持休眠狀態，直到存貯過程遇到適宜的環境才生長，這是包裹青貯腐敗的主要原因。所有腐敗青貯主要是由于空氣滲入包裹青貯窖中，尤其是空氣中的氧氣。包裹青貯存貯過程中被少量的空氣包圍。近期經驗表明，當筒倉密封后，氧氣會在短短的15分鐘內被細胞呼吸作和發酵完全消耗。

塑料膜不能阻止空氣進入青貯中，包裹青貯容易腐敗的原因如下：

1、包裹青貯與切割青貯的密封程度不同，增加包與包之間的空氣滲透。

2、包裹青貯發酵沒有切割青貯徹底，故酸濃度低且pH較高，從而不能抑制霉菌生長。

3、包裹青貯的干物質比切割青貯的高，包內發酵程度低，增加包內空氣滲透率。

4.與傳統的結構相比較，絕大多數包裹青貯是表面緊密接觸的“筒倉”。

5.包之間松散和塑料之間的空隙會使空氣滲透并累加，即使在寒冷氣候，運動和溫暖會使表面生長霉菌。密封緊密青貯塑料膜的優點：青貯與包緊密接觸，降低空氣進入塑料膜的能力，增加青貯包的溫度。